مرحله دوم آزمون اختصاصی طلاب در مقاطع کارشناسی ارشد و دکتری، با برگزاری مصاحبه حضوری در تمامی دانشکده‌های علوم قرآنی کشور و با حضور اعضای محترم هیئت علمی دانشگاه به عنوان مصاحبه‌کننده برگزار شد. در این مرحله، پذیرفته‌شدگان مرحله نخست آزمون کتبی برای جذب نهایی به دانشگاه معرفی می‌شوند.